В среднем мозге CN III топографически разделена на верхний отдел (иннервирующий верхнюю прямую мышцу и верхний подниматель верхнего века) и нижний отдел (иннервирующий внутреннюю и нижнюю прямые мышцы, нижнюю косую мышцу, сфинктер зрачка и мышцы цилиарного тела). Однако истинное анатомическое разделение на 2 ветви происходит на уровне передней части кавернозного синуса / верхней глазничной щели (обсуждается в следующем абзаце).

Фасцикулы CN III пересекают вентральную покрышку среднего мозга, проходя рядом и, возможно, через красное ядро, черную субстанцию и кортикоспинальные тракты внутри ножки мозга. Фасцикулы выходят на вентральной поверхности ножек (см. рис. 1-35). Хотя CN III считается единой структурой в субарахноидальном пространстве, как и в среднем мозге, нерв и его различные волокна топографически организованы. В субарахноидальном пространстве нерв проходит между SCA снизу и PCA сверху. Он идет слегка косо по отношению к краю намета мозжечка, параллельно и латерально по отношению к PCoA. Зрачковые волокна обычно располагаются на дорсомедиальной поверхности нерва, где они анатомически уязвимы для компрессии. Ункус, который является наиболее медиальным аспектом височной доли, расположен непосредственно над наметом мозжечка и субарахноидальной частью CN III. Односторонние супратенториальные объемные образования могут привести к смещению ункуса через вырезку намета мозжечка (ункальное вклинение) и компрессии ипсилатеральной CN III.

У заднего края твердой мозговой оболочки кливуса и кавернозного синуса нерв входит в собственный дуральный канал непосредственно над CN IV (см. рис. 1-35). Проходя вперед в верхней латеральной стенке кавернозного синуса, нерв разделяется на 2 отдела: верхний и нижний. Эти отделы входят в орбиту через верхнюю глазничную щель внутри кольца Цинна. Верхний отдел идет вперед внутри конуса, чтобы иннервировать сначала верхнюю прямую мышцу, а затем мышцу верхнего поднимателя верхнего века. Нижний отдел посылает парасимпатические волокна в цилиарный ганглий в верхушке орбиты примерно на 10 мм антериальнее кольца Цинна и латеральнее зрительного нерва. В цилиарном ганглии синаптируют волокна, предназначенные для сфинктера зрачка и цилиарного тела. Впоследствии волокна сопровождают ветвь, предназначенную для нижней косой мышцы. Количество волокон, связанных с аккомодацией и иннервирующих цилиарное тело, примерно в 9 или 10 раз превышает количество волокон, достигающих мышцы сфинктера зрачка. Это несоответствие может быть одной из причин развития свето-ближней диссоциации при зрачке Ади (см. главу 11). Остальные ветви CN III в орбите иннервируют внутреннюю и нижнюю прямые мышцы.

Ядро CN IV (блокового нерва) расположено в сером веществе в дорсальной части каудального отдела среднего мозга непосредственно под водопроводом, непосредственно примыкая к более ростральному ядру CN III (рис. 1-37). Интрааксиальная часть (фасцикул) CN IV очень короткая, она проходит дорсально вокруг периакведуктального серого вещества, чтобы перекреститься в передней занавеске продолговатого мозга непосредственно каудальнее нижних холмиков и ниже шишковидной железы. CN IV — единственный CN, который выходит на дорсальной поверхности ствола мозга, и имеет самый длинный незащищенный внутричерепной ход (что, вероятно, обуславливает его частое вовлечение при закрытых черепно-мозговых травмах). В субарахноидальном пространстве CN IV огибает средний мозг, параллельно намету мозжечка непосредственно под краем намета. В результате CN IV легко повреждается при нейрохирургических операциях, затрагивающих намета мозжечка.

Четвертый CN входит в задний латеральный аспект кавернозного синуса ниже переднего прикрепления намета мозжечка и под CN III. Прикрытый оболочкой переменной толщины, CN IV идет вперед по латеральной стенке кавернозного синуса. Спереди нерв пересекает CN III, чтобы войти в верхнюю глазничную щель. Вместе с лобным и слезным нервами CN V и SOV, CN IV проходит через верхнюю глазничную щель, но вне кольца Цинна. Затем CN IV пересекает зрительный нерв, чтобы войти в верхнюю косую мышцу в верхне-медиальной части орбиты.

Шестой черепной нерв (отводящий нерв) берет начало в дорсальной каудальной части моста, непосредственно под четвертым желудочком. Его ядро окружено петлеобразными волокнами (коленом) CN VII и прилежит к PPRF и MLF (рис. 1-38). Ядро CN VI содержит первичные мотонейроны и интернейроны, которые переходят на контрлатеральный MLF, чтобы достичь ядра CN III. Патология, поражающая ядро CN VI, вызывает односторонний паралич взора.

Моторные аксоны, выходящие из ядра CN VI, направляются вентрально и слегка латерально, медиальнее верхнего оливарного ядра, выходя на вентральной поверхности каудальной части моста. Проходя через ствол мозга, пучки лежат рядом со спинальным трактом CN V и пересекают кортикобульбарные тракты. Выходя из ствола мозга, нерв идет рострально в субарахноидальном пространстве по поверхности ската (clivus) от области мосто-мозжечкового угла до верхней части задней черепной ямки. Нерв пронзает твердую мозговую оболочку примерно на 1 см ниже верхушки пирамиды височной кости и проходит под петроклиноидным связочным аппаратом (связкой Грубера, которая соединяет пирамиду височной кости с задним клиноидом), чтобы войти в канал Дорелло. В канале CN VI проходит вместе с нижним каменистым синусом. Став экстрадуральным, нерв оказывается внутри кавернозного синуса, где он проходит параллельно горизонтальному сегменту сонной артерии и CN V₁ (рис. 1-39). CN VI является единственным ЧН, находящимся в толще кавернозного синуса; односторонний паралич CN VI и синдром Горнера локализуются здесь, так как к нерву на коротком сегменте присоединяются ветви окулосимпатического пути, расположенные в стенке интрапетрозной сонной артерии. Достигая передней части кавернозного синуса, CN VI проходит через верхнюю глазничную щель через кольцо Цинна (см. рис. 1-5), чтобы войти в медиальную поверхность наружной прямой мышцы.